Data de Exibição: 2 de Março de 2009

Após receber uma dica do “Rebel”, Matt Parkman e Peter Petrelli irão ao “Building 26″ tentar resgatar Daphne e recuperar os arquivos que expõe os planos do governo para aqueles com habilidades. Claire Bennet encontra uma ajuda improvável para a fuga de Alex. Já Sylar e Luke continuam sua viagem, onde Sylar começa a ter lembranças de seu pai, que o leva a saber a verdade sobre sua mãe. Enquanto isso, The Hunter colocará em ordem seus próprios assuntos e trará uma surpresa explosiva para um de nossos heróis.

Data de Exibição: 23 de Fevereiro de 2009

Permanecendo como refém, Noah Bennet será interrogado por Matt Parkman com um novo método que revelará qual a implicação deste no plano de Nathan Petrelli e do Governo dos U.S.A. para capturar todos aqueles que possuam habilidades. A descoberta levará Peter e Matt enfrentar cara-a-cara The Hunter.

Data de Exibição: 16 de Fevereiro de 2009
Os planos de Nathan Petrelli saem à luz e a Segurança Nacional começerá uma investigação por uma ordem vinda directamente do Presidente do E.U.A.
Sylar e o seu novo “colega”, Luke irão começar uma viagem para conhecer o pai biológico de Sylar, mas durante esta viagem serão ambos capturados por agentes especiais do Nathan. A vida da família Bennet complica-se ainda mais quando Claire Bennet tenta proteger um jovem com poderes, do seu próprio pai, Noah Bennet. Nisto, Matt Parkman, Hiro Nakamura e Ando, tentarão evitar as imagens proféticas que o telepata viu. Ao tentar evitar esta profecia, o caminho os levará à Índia onde irão encontrar um misterioso aliado.

Data de Exibição: 09 de Fevereiro de 2009

Seguindo uma sequência de acontecimento inesperados, os nosso Heroes estão-se a converter em Fugitivos do seu novo adversário Nathan Petrelli. Após pintar uma série de imagens proféticas, Matt Parkman vê-se obrigado a tentar evitar o trágico destino que se apresenta a alguém próximo a ele, Daphne.
Sylar continua a busca do seu verdadeiro pai, seu pai biológico, e irá encontrar um jovem com alguma informação, e, este jovem tem os seus próprios poderes.

(Data de Exibição: 2 de Fevereiro de 2009)

Meses após a explosão que ocorreu na Pinehearst e na Primatech, os nossos heroes estão a tentar deixar o passado distante ao tentar iniciar uma nova vida.
Hiro Nakamura, ainda sem o seu poder de Teletransporte e Manipulação do Espaço e Tempo, com o seu amigo Ando, estão-se a treinar para se tornarem num verdadeiro herói. O prefessor Mohinder Suresh volta à sua vida como taxista e Peter Petrelli retorna à sua “obsessão” de querer salvar outras pessoas.
Matt Parkman e Daphne tentam viver uma vida normal como qualquer outro casal.
Claire Bennet, embora esteja a tentar viver uma vida normal, fica frustrada quando descobre que existe uma conspiração com o Governo e o seu Pai biológico, Nathan Petrelli, para localizar e deter todos aqueles que tiverem habilidades especiais.
Por outro lado, Sylar parte em busca de encontrar os seus pais verdadeiros.